GENOM 2005
Анализ микрочипов для массивов Affymetrix
Многофункциональное и удобное приложение для анализа экспериментов с массивами данных (например, от поставщика Affymetrix). Оно включает в себя дополнительную информацию о генах, множество методов анализа, автоматическое картирование путей с помощью редактора, предсказание функций...
Анализ ДНК с помощью микрочипов
Genom 2005 представляет данные разными цветами для каждого сигнала. Вы получаете быстрый обзор данных. В каждой строке представлены название гена и номер присоединения для каждого набора зондов.
График экспрессии генов
Это диаграмма с одним массивом. На ней показан столбик для каждого набора зондов.
3D-обзор
Вы можете отобразить каждый сигнал на массиве в 3D-виде. Сравнивая его с другим массивом, вы легко найдете интересные наборы зондов. Вы также можете сортировать сигналы по функции гена или его местоположению.
Расположение хромосомы
В этом представлении отображаются все наборы зондов, упорядоченные по их расположению на хромосоме.
Процесс экспрессии генов
На этом скриншоте показан график, где каждый зонд представлен линией. Он показывает повышение/понижение регуляции гена в разное время.
Вид на путь
На этом скриншоте показан загруженный путь, который напрямую сочетается с загруженными данными массива.
Редактор путей
С помощью встроенного редактора карт вы можете легко создавать новые или редактировать существующие маршруты.
Прогнозирование функций генов
Часто у вас нет информации о наборе пробников, потому что это EST или он не был проанализирован ранее. С помощью этого модуля вы можете получить новую информацию о зондах или пользовательских последовательностях с помощью поиска BLAST (онлайн). После этого будут показаны возможные новые функции генов.
Прогнозирование функций Подробнее
Подробная информация о предсказании функции.
Исследование PubMED
PubMED - крупнейшая в мире база данных с медицинскими статьями (размещена на сайте Ncbi). Данный модуль выполняет поиск в этой базе данных и возвращает результаты, соответствующие введенному термину (или гену).
Исследование MeSH
MeSH (Medical Subject Headings) предоставляет упорядоченные термины для улучшения поиска в PubMED, например.
Генная сеть
Взаимосвязь генов, описанных в аннотациях из PubMED, представлена здесь в виде диаграммы отношений.
Функции генов для микрочипов
Этот алгоритм представляет данные в виде таблицы со всеми функциями генов, которые вы ранее отфильтровали, или может быть выполнен для всего массива.
Генная онтология для массива
Это отображает функции генов в виде представления, подобного GeneOntology.
Информация о зондах
Диалог информации о гене. Здесь вы получите более подробную информацию по искомому запросу: последовательность, описание и т. д.
Подробная информация о наборе зондов
На этом снимке экрана вы можете напрямую перейти по ссылкам для получения дополнительной информации о вашем запросе. В отличие от других программ, вы можете нажать на ссылку и перейти непосредственно на страницу с результатом, не заполняя веб-формы.
Функции для Probeset
Еще один граф GeneOntology для функций гена из гена.
Исследование Интернета
На этом скриншоте вы видите прямые ссылки для получения дополнительной информации по вашему запросу. В отличие от других программ, вы можете нажать на ссылку и попасть непосредственно на страницу с результатом, не заполняя веб-формы.
Кластерный вид
Этот кластер можно легко составить. Он показывает наиболее одинаковые значения, попарно соединенные на графике.
Скаттерплот
Еще один вид из алгоритма кластеризации.
Что говорят наши клиенты
Более 20 лет существования и тысячи довольных клиентов.