GENOM 2005
Análisis de micromatrices para matrices Affymetrix
Aplicación rica en funciones y fácil de usar para analizar experimentos con arrays (por ejemplo, del proveedor Affymetrix). Incluye información adicional de genes, múltiples métodos de análisis, mapeo automático de rutas con un editor, predicción de funciones...
Análisis de ADN por microarrays
Genom 2005 presenta los datos en diferentes colores para cada señal. Usted tiene una visión rápida de los datos. En cada fila se presenta un nombre de gen y un número de acceso para cada conjunto de sondas.
Gráfico de expresión génica
Este es un diagrama con un array. Muestra una barra para cada conjunto de sondas.
Vista 3D
Puedes visualizar cada señal de tu array en una vista 3D. Al compararlo con otro array, puede encontrar fácilmente conjuntos de sondas interesantes. También puede ordenar las señales por función o localización génica.
Localización cromosómica
Esta vista muestra todos los conjuntos de sondas ordenados por su ubicación en el cromosoma.
Proceso de expresión génica
Esta captura de pantalla muestra un gráfico en el que cada conjunto de sondas está representado por una línea. Muestra la regulación ascendente/descendente de un gen entre diferentes tiempos.
Vista del camino
Esta captura de pantalla muestra una vía cargada que se combina directamente con los datos de la matriz que ha cargado.
Editor de itinerarios
Con este editor de mapas integrado, puedes crear fácilmente nuevas rutas o editar una ya existente.
Predicción de la función génica
A menudo no se tiene información sobre un probeset porque es un EST o no ha sido analizado antes. Con este módulo puede obtener nueva información de probesets o secuencias personalizadas mediante una búsqueda BLAST (en línea). A continuación, se mostrarán posibles nuevas funciones génicas.
Detalles de la predicción de funciones
Detalles sobre la predicción de la función.
Investigación PubMED
PubMED es la mayor base de datos del mundo con artículos médicos (alojada en la web del Ncbi). Este módulo busca en esa base de datos y devuelve resultados relevantes para el término (o gen) introducido.
Investigación MeSH
MeSH (Medical Subject Headings) proporciona términos ordenados para mejorar las búsquedas en PubMED, por ejemplo.
Red genética
La relación de los genes descritos en los resúmenes de PubMED se muestran aquí como diagrama de relación.
Funciones génicas para microarrays
Este algoritmo presenta los datos en una tabla con todas las funciones génicas de los genes previamente filtrados, o puede hacerse para todo el array.
GeneOntología para una matriz
Muestra las funciones de los genes en una vista similar a GeneOntology.
Información de Probeset
El diálogo de información del gen. Aquí puede obtener información más detallada de la consulta buscada, como la secuencia, la descripción y mucho más.
Detalles de la sonda
En esta captura de pantalla, puede acceder directamente a los enlaces para obtener más información sobre su consulta. A diferencia de otros programas, puede hacer clic en un enlace y acceder directamente a la página de resultados sin necesidad de rellenar formularios web.
Funciones para Probeset
Otro gráfico GeneOntology de las funciones genéticas del gen.
Investigación en Internet
En esta captura de pantalla puedes ver enlaces directos para obtener más información sobre tu consulta. A diferencia de otros programas, puede hacer clic en un enlace y acceder directamente a la página de resultados sin necesidad de rellenar formularios web.
Vista del clúster
Esta agrupación se puede hacer fácilmente. Muestra los valores más iguales emparejados en un gráfico.
Gráfico de dispersión
Otra vista del algoritmo de agrupación.
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