Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TBX21
Ідентифікатори
Символи
TBX21 , T-PET, T-bet, TBET, TBLYM, T-box 21, T-box transcription factor 21, IMD88
Зовнішні ІД
OMIM : 604895 MGI: 1888984 HomoloGene: 8353 GeneCards: TBX21
Пов'язані генетичні захворювання
aspirin-exacerbated respiratory disease [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• soma • клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • cellular response to organic substance • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes • response to virus • T cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lymphocyte migration • transcription, DNA-templated • regulation of immune response • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of interleukin-2 production • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of T cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation • negative regulation of T-helper 17 cell lineage commitment • negative regulation of T-helper 2 cell cytokine production • GO:1901313 positive regulation of gene expression
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 47.73 – 47.75 Mb
Хр. 11: 96.99 – 97.01 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
TBX21 (англ. T-box 21 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 535 амінокислот , а молекулярна маса — 58 328[ 5] .
Послідовність амінокислот
10
20
30
40
50
MGIVEPGCGD
MLTGTEPMPG
SDEGRAPGAD
PQHRYFYPEP
GAQDADERRG
GGSLGSPYPG
GALVPAPPSR
FLGAYAYPPR
PQAAGFPGAG
ESFPPPADAE
GYQPGEGYAA
PDPRAGLYPG
PREDYALPAG
LEVSGKLRVA
LNNHLLWSKF
NQHQTEMIIT
KQGRRMFPFL
SFTVAGLEPT
SHYRMFVDVV
LVDQHHWRYQ
SGKWVQCGKA
EGSMPGNRLY
VHPDSPNTGA
HWMRQEVSFG
KLKLTNNKGA
SNNVTQMIVL
QSLHKYQPRL
HIVEVNDGEP
EAACNASNTH
IFTFQETQFI
AVTAYQNAEI
TQLKIDNNPF
AKGFRENFES
MYTSVDTSIP
SPPGPNCQFL
GGDHYSPLLP
NQYPVPSRFY
PDLPGQAKDV
VPQAYWLGAP
RDHSYEAEFR
AVSMKPAFLP
SAPGPTMSYY
RGQEVLAPGA
GWPVAPQYPP
KMGPASWFRP
MRTLPMEPGP
GGSEGRGPED
QGPPLVWTEI
APIRPESSDS
GLGEGDSKRR
RVSPYPSSGD
SSSPAGAPSP
FDKEAEGQFY
NYFPN
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121— 2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші