TAF1

TAF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1EQF, 3AAD, 3UV4, 3UV5, 4RGW, 4YYM, 4YYN, 5I29, 5I1Q, 5FUR
Ідентифікатори
Символи	TAF1, BA2R, CCG1, CCGS, DYT3, DYT3/KAT4, N-NSCL2, OF, P250, TAF(II)250, TAF2A, TAFII-250, TAFII250, XDP, MRXS33, TATA-box binding protein associated factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 313650 MGI: 1336878 HomoloGene: 37942 GeneCards: TAF1
Пов'язані генетичні захворювання
	X-linked dystonia-parkinsonism
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • DNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • p53 binding; • transcription factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • lysine-acetylated histone binding; • TBP-class protein binding; • acyltransferase activity; • ATP binding; • protein serine/threonine kinase activity; • histone acetyltransferase activity; • kinase activity; • protein heterodimerization activity; • H3K27me3 modified histone binding; • ubiquitin conjugating enzyme activity; • acetyl-CoA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • MLL1 complex; • клітинне ядро; • ядерце; • transcription regulator complex; • transcription factor TFIID complex;
Біологічний процес	• фосфорилювання; • RNA polymerase II preinitiation complex assembly; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • transcription, DNA-templated; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • DNA-templated transcription, initiation; • protein autophosphorylation; • клітинний цикл; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • peptidyl-threonine phosphorylation; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • GO:0022415 viral process; • histone acetylation; • protein polyubiquitination; • protein phosphorylation; • cellular response to DNA damage stimulus; • negative regulation of gene expression; • midbrain development; • positive regulation of protein binding; • cellular response to UV; • transcription factor catabolic process; • protein stabilization; • regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • cellular response to ATP; • regulation of cell cycle G1/S phase transition; • negative regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding; • negative regulation of protein autoubiquitination; • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process; • positive regulation of androgen receptor activity; • positive regulation of transcription by RNA polymerase I; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to UV-induced DNA damage; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6872
	270627
	ENSG00000147133
	ENSMUSG00000031314
	P21675
	Q80UV9
	NM_001286074; NM_004606; NM_138923
	NM_001081008; NM_001290729
	NP_001273003; NP_004597; NP_620278
	NP_001277658; NP_001392888; NP_001392889; NP_001392890; NP_001392891
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF1 (англ. TATA-box binding protein associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 872 амінокислот, а молекулярна маса — 212 677^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPGCDLLLR	TAATITAAAI	MSDTDSDEDS	AGGGPFSLAG	FLFGNINGAG
QLEGESVLDD	ECKKHLAGLG	ALGLGSLITE	LTANEELTGT	DGALVNDEGW
VRSTEDAVDY	SDINEVAEDE	SRRYQQTMGS	LQPLCHSDYD	EDDYDADCED
IDCKLMPPPP	PPPGPMKKDK	DQDSITGEKV	DFSSSSDSES	EMGPQEATQA
ESEDGKLTLP	LAGIMQHDAT	KLLPSVTELF	PEFRPGKVLR	FLRLFGPGKN
VPSVWRSARR	KRKKKHRELI	QEEQIQEVEC	SVESEVSQKS	LWNYDYAPPP
PPEQCLSDDE	ITMMAPVESK	FSQSTGDIDK	VTDTKPRVAE	WRYGPARLWY
DMLGVPEDGS	GFDYGFKLRK	TEHEPVIKSR	MIEEFRKLEE	NNGTDLLADE
NFLMVTQLHW	EDDIIWDGED	VKHKGTKPQR	ASLAGWLPSS	MTRNAMAYNV
QQGFAATLDD	DKPWYSIFPI	DNEDLVYGRW	EDNIIWDAQA	MPRLLEPPVL
TLDPNDENLI	LEIPDEKEEA	TSNSPSKESK	KESSLKKSRI	LLGKTGVIKE
EPQQNMSQPE	VKDPWNLSND	EYYYPKQQGL	RGTFGGNIIQ	HSIPAVELRQ
PFFPTHMGPI	KLRQFHRPPL	KKYSFGALSQ	PGPHSVQPLL	KHIKKKAKMR
EQERQASGGG	EMFFMRTPQD	LTGKDGDLIL	AEYSEENGPL	MMQVGMATKI
KNYYKRKPGK	DPGAPDCKYG	ETVYCHTSPF	LGSLHPGQLL	QAFENNLFRA
PIYLHKMPET	DFLIIRTRQG	YYIRELVDIF	VVGQQCPLFE	VPGPNSKRAN
THIRDFLQVF	IYRLFWKSKD	RPRRIRMEDI	KKAFPSHSES	SIRKRLKLCA
DFKRTGMDSN	WWVLKSDFRL	PTEEEIRAMV	SPEQCCAYYS	MIAAEQRLKD
AGYGEKSFFA	PEEENEEDFQ	MKIDDEVRTA	PWNTTRAFIA	AMKGKCLLEV
TGVADPTGCG	EGFSYVKIPN	KPTQQKDDKE	PQPVKKTVTG	TDADLRRLSL
KNAKQLLRKF	GVPEEEIKKL	SRWEVIDVVR	TMSTEQARSG	EGPMSKFARG
SRFSVAEHQE	RYKEECQRIF	DLQNKVLSST	EVLSTDTDSS	SAEDSDFEEM
GKNIENMLQN	KKTSSQLSRE	REEQERKELQ	RMLLAAGSAA	SGNNHRDDDT
ASVTSLNSSA	TGRCLKIYRT	FRDEEGKEYV	RCETVRKPAV	IDAYVRIRTT
KDEEFIRKFA	LFDEQHREEM	RKERRRIQEQ	LRRLKRNQEK	EKLKGPPEKK
PKKMKERPDL	KLKCGACGAI	GHMRTNKFCP	LYYQTNAPPS	NPVAMTEEQE
EELEKTVIHN	DNEELIKVEG	TKIVLGKQLI	ESADEVRRKS	LVLKFPKQQL
PPKKKRRVGT	TVHCDYLNRP	HKSIHRRRTD	PMVTLSSILE	SIINDMRDLP
NTYPFHTPVN	AKVVKDYYKI	ITRPMDLQTL	RENVRKRLYP	SREEFREHLE
LIVKNSATYN	GPKHSLTQIS	QSMLDLCDEK	LKEKEDKLAR	LEKAINPLLD
DDDQVAFSFI	LDNIVTQKMM	AVPDSWPFHH	PVNKKFVPDY	YKVIVNPMDL
ETIRKNISKH	KYQSRESFLD	DVNLILANSV	KYNGPESQYT	KTAQEIVNVC
YQTLTEYDEH	LTQLEKDICT	AKEAALEEAE	LESLDPMTPG	PYTPQPPDLY
DTNTSLSMSR	DASVFQDESN	MSVLDIPSAT	PEKQVTQEGE	DGDGDLADEE
EGTVQQPQAS	VLYEDLLMSE	GEDDEEDAGS	DEEGDNPFSA	IQLSESGSDS
DVGSGGIRPK	QPRMLQENTR	MDMENEESMM	SYEGDGGEAS	HGLEDSNISY
GSYEEPDPKS	NTQDTSFSSI	GGYEVSEEEE	DEEEEEQRSG	PSVLSQVHLS
EDEEDSEDFH	SIAGDSDLDS	DE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sekiguchi T., Nohiro Y., Nakamura Y., Hisamoto N., Nishimoto T. (1991). The human CCG1 gene, essential for progression of the G1 phase, encodes a 210-kilodalton nuclear DNA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 11: 3317—3325. PMID 2038334 doi:10.1128/MCB.11.6.3317
Ruppert S., Wang E.H., Tjian R. (1993). Cloning and expression of human TAFII250: a TBP-associated factor implicated in cell-cycle regulation. Nature. 362: 175—179. PMID 7680771 doi:10.1038/362175a0
Nolte D., Niemann S., Muller U. (2003). Specific sequence changes in multiple transcript system DYT3 are associated with X-linked dystonia parkinsonism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 10347—10352. PMID 12928496 doi:10.1073/pnas.1831949100
Herzfeld T., Nolte D., Muller U. (2007). Structural and functional analysis of the human TAF1/DYT3 multiple transcript system. Mamm. Genome. 18: 787—795. PMID 17952504 doi:10.1007/s00335-007-9063-z
Dikstein R., Ruppert S., Tjian R. (1996). TAFII250 is a bipartite protein kinase that phosphorylates the base transcription factor RAP74. Cell. 84: 781—790. PMID 8625415 doi:10.1016/S0092-8674(00)81055-7
Damania B., Alwine J.C. (1996). TAF-like function of SV40 large T antigen. Genes Dev. 10: 1369—1381. PMID 8647434 doi:10.1101/gad.10.11.1369

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TAF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11535 (англ.) . Архів оригіналу за 25 липня 2017. Процитовано 13 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-25 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P21675 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TAF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11535 (англ.) . Архів оригіналу за 25 липня 2017. Процитовано 13 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-25 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P21675 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]