PSMC5

PSMC5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KRK, 3KW6
Ідентифікатори
Символи	PSMC5, S8, SUG-1, SUG1, TBP10, TRIP1, p45, p45/SUG, proteasome 26S subunit, ATPase 5, RPT6
Зовнішні ІД	OMIM: 601681 MGI: 105047 HomoloGene: 2098 GeneCards: PSMC5
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • thyrotropin-releasing hormone receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • signaling receptor binding • hydrolase activity • ATPase activity • TBP-class protein binding • transcription factor binding • proteasome-activating activity Клітинна компонента • гіалоплазма • proteasome regulatory particle, base subcomplex • blood microparticle • мембрана • proteasome regulatory particle • нуклеоплазма • inclusion body • екзосома • GO:0016023 цитоплазматичний міхур • Протеасома • cytosolic proteasome complex • цитоплазма • proteasome accessory complex • клітинне ядро • nuclear proteasome complex • postsynapse Біологічний процес • positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of inclusion body assembly • MAPK cascade • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0044257 protein catabolic process • NIK/NF-kappaB signaling • ubiquitin-dependent ERAD pathway • negative regulation of programmed cell death • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • modulation of chemical synaptic transmission • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5705	19184
Ensembl	ENSG00000087191	ENSMUSG00000020708
UniProt	P62195	P62196
RefSeq (мРНК)	NM_001199163 NM_002805	NM_008950
RefSeq (білок)	NP_001186092 NP_002796	NP_032976
Локус (UCSC)	Хр. 17: 63.83 – 63.83 Mb	Хр. 11: 106.15 – 106.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSMC5 (англ. Proteasome 26S subunit, ATPase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 45 626.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALDGPEQME		LEEGKAGSGL		RQYYLSKIEE		LQLIVNDKSQ		NLRRLQAQRN
ELNAKVRLLR		EELQLLQEQG		SYVGEVVRAM		DKKKVLVKVH		PEGKFVVDVD
KNIDINDVTP		NCRVALRNDS		YTLHKILPNK		VDPLVSLMMV		EKVPDSTYEM
IGGLDKQIKE		IKEVIELPVK		HPELFEALGI		AQPKGVLLYG		PPGTGKTLLA
RAVAHHTDCT		FIRVSGSELV		QKFIGEGARM		VRELFVMARE		HAPSIIFMDE
IDSIGSSRLE		GGSGGDSEVQ		RTMLELLNQL		DGFEATKNIK		VIMATNRIDI
LDSALLRPGR		IDRKIEFPPP		NEEARLDILK		IHSRKMNLTR		GINLRKIAEL
MPGASGAEVK		GVCTEAGMYA		LRERRVHVTQ		EDFEMAVAKV		MQKDSEKNMS
IKKLWK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 doi:10.1210/mend.9.2.7776974
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Chen Y., Sharp Z.D., Lee W.-H. (1997). HEC binds to the seventh regulatory subunit of the 26 S proteasome and modulates the proteolysis of mitotic cyclins. J. Biol. Chem. 272: 24081—24087. PMID 9295362 doi:10.1074/jbc.272.38.24081
• Zheng L., Chen Y., Lee W.-H. (1999). Hec1p, an evolutionarily conserved coiled-coil protein, modulates chromosome segregation through interaction with SMC proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5417—5428. PMID 10409732 doi:10.1128/MCB.19.8.5417
• Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 doi:10.1038/nsmb.3273

Див. також

• Хромосома 17