NFYA

NFYA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4AWL
Ідентифікатори
Символи	NFYA, CBF-A, CBF-B, HAP2, NF-YA, nuclear transcription factor Y subunit alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 189903 MGI: 97316 HomoloGene: 32114 GeneCards: NFYA
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • CCAAT-binding factor complex • protein-DNA complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • ритмічний процес • regulation of cholesterol biosynthetic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4800	18044
Ensembl	ENSG00000001167	ENSMUSG00000023994
UniProt	P23511	P23708
RefSeq (мРНК)	NM_021705 NM_002505	NM_001110832 NM_010913 NM_001347401 NM_001347402 NM_001374803
RefSeq (білок)	NP_002496 NP_068351	NP_001104302 NP_001334330 NP_001334331 NP_035043 NP_001361732
Локус (UCSC)	Хр. 6: 41.07 – 41.1 Mb	Хр. 17: 48.69 – 48.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFYA (англ. Nuclear transcription factor Y subunit alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот, а молекулярна маса — 36 877.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQYTANSNS		STEQIVVQAG		QIQQQQQGGV		TAVQLQTEAQ		VASASGQQVQ
TLQVVQGQPL		MVQVSGGQLI		TSTGQPIMVQ		AVPGGQGQTI		MQVPVSGTQG
LQQIQLVPPG		QIQIQGGQAV		QVQGQQGQTQ		QIIIQQPQTA		VTAGQTQTQQ
QIAVQGQQVA		QTAEGQTIVY		QPVNADGTIL		QQVTVPVSGM		ITIPAASLAG
AQIVQTGANT		NTTSSGQGTV		TVTLPVAGNV		VNSGGMVMMV		PGAGSVPAIQ
RIPLPGAEML		EEEPLYVNAK		QYHRILKRRQ		ARAKLEAEGK		IPKERRKYLH
ESRHRHAMAR		KRGEGGRFFS		PKEKDSPHMQ		DPNQADEEAM		TQIIRVS

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Becker D.M., Fikes J.D., Guarente L. (1991). A cDNA encoding a human CCAAT-binding protein cloned by functional complementation in yeast. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 1968—1972. PMID 2000400 doi:10.1073/pnas.88.5.1968
• Yamada K., Printz R.L., Osawa H., Granner D.K. (1999). Human ZHX1: cloning, chromosomal location, and interaction with transcription factor NF-Y. Biochem. Biophys. Res. Commun. 261: 614—621. PMID 10441475 doi:10.1006/bbrc.1999.1087
• Yamada K., Osawa H., Granner D.K. (1999). Identification of proteins that interact with NF-YA. FEBS Lett. 460: 41—45. PMID 10571058 doi:10.1016/S0014-5793(99)01311-3
• Lim K., Chang H.I. (2009). O-GlcNAcylation of Sp1 interrupts Sp1 interaction with NF-Y. Biochem. Biophys. Res. Commun. 382: 593—597. PMID 19302979 doi:10.1016/j.bbrc.2009.03.075

Див. також

• Хромосома 6