NFIB

NFIB
Ідентифікатори
Символи	NFIB, CTF, HMGIC/NF-I/B, NF1-B, NFI-B, NFI-RED, NFIB2, NFIB3, nuclear factor I B, MACID
Зовнішні ІД	OMIM: 600728 MGI: 103188 HomoloGene: 4087 GeneCards: NFIB
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • зв’язування дволанцюгових ДНК; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний; • cerebellar mossy fiber; • клітинне ядро; • fibrillar center;
Біологічний процес	• cell differentiation involved in salivary gland development; • club cell differentiation; • negative regulation of epithelial cell proliferation involved in lung morphogenesis; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of mesenchymal cell proliferation involved in lung development; • chondrocyte differentiation; • lung development; • negative regulation of DNA binding; • salivary gland cavitation; • hindbrain development; • glial cell differentiation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • commissural neuron axon guidance; • transcription, DNA-templated; • anterior commissure morphogenesis; • lung ciliated cell differentiation; • реплікація ДНК; • type I pneumocyte differentiation; • principal sensory nucleus of trigeminal nerve development; • forebrain development; • type II pneumocyte differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cell population proliferation; • transcription by RNA polymerase II; • response to bacterium;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4781
	18028
	ENSG00000147862
	ENSMUSG00000008575
	O00712
	P97863
	NM_001190737; NM_001190738; NM_001282787; NM_005596
	NM_001113209; NM_001113210; NM_001286127; NM_001286131; NM_008687
NP_001177666; NP_001177667; NP_001269716; NP_005587; NP_001356387;
	NP_001356388; NP_001356389; NP_001356390; NP_001356391; NP_001356392; NP_001356393; NP_001356394; NP_001356395; NP_001356396; NP_001356397; NP_001356398; NP_001356399; NP_001356400; NP_001356401; NP_001356402; NP_001356403; NP_001356404; NP_001356405; NP_001356406; NP_001356407; NP_001356408; NP_001356409; NP_001356410
	NP_001106680; NP_001106681; NP_001273056; NP_001273060; NP_032713
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NFIB (англ. Nuclear factor I B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 420 амінокислот, а молекулярна маса — 47 442^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMYSPICLTQ	DEFHPFIEAL	LPHVRAIAYT	WFNLQARKRK	YFKKHEKRMS
KDEERAVKDE	LLSEKPEIKQ	KWASRLLAKL	RKDIRQEYRE	DFVLTVTGKK
HPCCVLSNPD	QKGKIRRIDC	LRQADKVWRL	DLVMVILFKG	IPLESTDGER
LMKSPHCTNP	ALCVQPHHIT	VSVKELDLFL	AYYVQEQDSG	QSGSPSHNDP
AKNPPGYLED	SFVKSGVFNV	SELVRVSRTP	ITQGTGVNFP	IGEIPSQPYY
HDMNSGVNLQ	RSLSSPPSSK	RPKTISIDEN	MEPSPTGDFY	PSPSSPAAGS
RTWHERDQDM	SSPTTMKKPE	KPLFSSASPQ	DSSPRLSTFP	QHHHPGIPGV
AHSVISTRTP	PPPSPLPFPT	QAILPPAPSS	YFSHPTIRYP	PHLNPQDTLK
NYVPSYDPSS	PQTSQSWYLG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Liu Y., Bernard H.U., Apt D. (1997). NFI-B3, a novel transcriptional repressor of the nuclear factor I family, is generated by alternative RNA processing. J. Biol. Chem. 272: 10739—10745. PMID 9099724 doi:10.1074/jbc.272.16.10739
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Qian F., Kruse U., Lichter P., Sippel A.E. (1995). Chromosomal localization of the four genes (NFIA, B, C, and X) for the human transcription factor nuclear factor I by FISH. Genomics. 28: 66—73. PMID 7590749 doi:10.1006/geno.1995.1107

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7785 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O00712 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7785 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O00712 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]