IRF8

IRF8
Ідентифікатори
Символи	IRF8, H-ICSBP, ICSBP, ICSBP1, IMD32A, IMD32B, IRF-8, interferon regulatory factor 8
Зовнішні ІД	OMIM: 601565 MGI: 96395 HomoloGene: 1629 GeneCards: IRF8
Пов'язані генетичні захворювання
хронічний лімфолейкоз, Інфекція, яку спричинює вірус Епштейна — Барр
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • гіалоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • myeloid cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to bacterium • positive regulation of interleukin-12 production • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of interferon-gamma production • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • defense response to bacterium • type I interferon signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • Фагоцитоз • cellular response to lipopolysaccharide • defense response to protozoan • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to interferon-gamma • автофагія • процес імунної системи Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3394	15900
Ensembl	ENSG00000140968	ENSMUSG00000041515
UniProt	Q02556	P23611
RefSeq (мРНК)	NM_002163 NM_001363907 NM_001363908	NM_001301811 NM_008320
RefSeq (білок)	NP_002154 NP_001350836 NP_001350837	NP_001288740 NP_032346
Локус (UCSC)	Хр. 16: 85.9 – 85.92 Mb	Хр. 8: 121.46 – 121.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRF8 (англ. Interferon regulatory factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 48 356.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCDRNGGRRL		RQWLIEQIDS		SMYPGLIWEN		EEKSMFRIPW		KHAGKQDYNQ
EVDASIFKAW		AVFKGKFKEG		DKAEPATWKT		RLRCALNKSP		DFEEVTDRSQ
LDISEPYKVY		RIVPEEEQKC		KLGVATAGCV		NEVTEMECGR		SEIDELIKEP
SVDDYMGMIK		RSPSPPEACR		SQLLPDWWAQ		QPSTGVPLVT		GYTTYDAHHS
AFSQMVISFY		YGGKLVGQAT		TTCPEGCRLS		LSQPGLPGTK		LYGPEGLELV
RFPPADAIPS		ERQRQVTRKL		FGHLERGVLL		HSSRQGVFVK		RLCQGRVFCS
GNAVVCKGRP		NKLERDEVVQ		VFDTSQFFRE		LQQFYNSQGR		LPDGRVVLCF
GEEFPDMAPL		RSKLILVQIE		QLYVRQLAEE		AGKSCGAGSV		MQAPEEPPPD
QVFRMFPDIC		ASHQRSFFRE		NQQITV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16