IFI16

IFI16
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2OQ0, 3B6Y, 3RLN, 3RLO, 3RNU, 4QGU
Ідентифікатори
Символи	IFI16, IFNGIP1, PYHIN2, interferon gamma inducible protein 16
Зовнішні ІД	OMIM: 147586 MGI: 3695276 HomoloGene: 115929 GeneCards: IFI16
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит, целіакія
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • identical protein binding • зв’язування дволанцюгових ДНК • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • нуклеоплазма • клітинне ядро • мембрана • nuclear speck • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of type I interferon production • GO:0032737 positive regulation of cytokine production • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • cellular response to glucose starvation • transcription, DNA-templated • negative regulation of viral genome replication • negative regulation of innate immune response • monocyte differentiation • cellular response to ionizing radiation • negative regulation of DNA binding • regulation of autophagy • myeloid cell differentiation • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • GO:0097285 апоптоз • кровотворення • activation of cysteine-type endopeptidase activity • автофагія • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of interleukin-1 beta production • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Епігенетичне успадкування • проліферація • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • activation of innate immune response • процес імунної системи • inflammatory response • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • вроджений імунітет • defense response to virus • cellular response to interferon-beta Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3428	623121
Ensembl	ENSG00000163565	ENSMUSG00000073491
UniProt	Q16666	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001206567 NM_005531 NM_001364867 NM_001376587 NM_001376588 NM_001376589 NM_001376591 NM_001376592	NM_001033384 NM_001177349 NM_001177350 NM_001368798 NM_001368799
RefSeq (білок)	NP_001193496 NP_005522 NP_001351796 NP_001363516 NP_001363517 NP_001363518 NP_001363520 NP_001363521	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 159 – 159.06 Mb	Хр. 1: 173.39 – 173.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IFI16 (англ. Interferon gamma inducible protein 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 88 256.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKKYKNIVL		LKGLEVINDY		HFRMVKSLLS		NDLKLNLKMR		EEYDKIQIAD
LMEEKFRGDA		GLGKLIKIFE		DIPTLEDLAE		TLKKEKLKVK		GPALSRKRKK
EVDATSPAPS		TSSTVKTEGA		EATPGAQKRK		KSTKEKAGPK		GSKVSEEQTQ
PPSPAGAGMS		TAMGRSPSPK		TSLSAPPNSS		STENPKTVAK		CQVTPRRNVL
QKRPVIVKVL		STTKPFEYET		PEMEKKIMFH		ATVATQTQFF		HVKVLNTSLK
EKFNGKKIII		ISDYLEYDSL		LEVNEESTVS		EAGPNQTFEV		PNKIINRAKE
TLKIDILHKQ		ASGNIVYGVF		MLHKKTVNQK		TTIYEIQDDR		GKMDVVGTGQ
CHNIPCEEGD		KLQLFCFRLR		KKNQMSKLIS		EMHSFIQIKK		KTNPRNNDPK
SMKLPQEQRQ		LPYPSEASTT		FPESHLRTPQ		MPPTTPSSSF		FTKKSEDTIS
KMNDFMRMQI		LKEGSHFPGP		FMTSIGPAES		HPHTPQMPPS		TPSSSFLTTK
SEDTISKMND		FMRMQILKEG		SHFPGPFMTS		IGPAESHPHT		PQMPPSTPSS
SFLTTLKPRL		KTEPEEVSIE		DSAQSDLKEV		MVLNATESFV		YEPKEQKKMF
HATVATENEV		FRVKVFNIDL		KEKFTPKKII		AIANYVCRNG		FLEVYPFTLV
ADVNADRNME		IPKGLIRSAS		VTPKINQLCS		QTKGSFVNGV		FEVHKKNVRG
EFTYYEIQDN		TGKMEVVVHG		RLTTINCEEG		DKLKLTCFEL		APKSGNTGEL
RSVIHSHIKV		IKTRKNKKDI		LNPDSSMETS		PDFFF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, автофагія, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Trapani J.A., Dawson M.J., Apostolidis V.A., Browne K.A. (1994). Genomic organization of IFI16, an interferon-inducible gene whose expression is associated with human myeloid cell differentiation: correlation of predicted protein domains with exon organization. Immunogenetics. 40: 415—424. PMID 7959953 doi:10.1007/BF00177824
• Xin H., Curry J., Johnstone R.W., Nickoloff B.J., Choubey D. (2003). Role of IFI 16, a member of the interferon-inducible p200-protein family, in prostate epithelial cellular senescence. Oncogene. 22: 4831—4840. PMID 12894224 doi:10.1038/sj.onc.1206754
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Johnstone R.W., Kershaw M.H., Trapani J.A. (1998). Isotypic variants of the interferon-inducible transcriptional repressor IFI 16 arise through differential mRNA splicing. Biochemistry. 37: 11924—11931. PMID 9718316 doi:10.1021/bi981069a
• Dawson M.J., Trapani J.A. (1995). IFI 16 gene encodes a nuclear protein whose expression is induced by interferons in human myeloid leukaemia cell lines. J. Cell. Biochem. 57: 39—51. PMID 7536752 doi:10.1002/jcb.240570106
• Johnstone R.W., Kerry J.A., Trapani J.A. (1998). The human interferon-inducible protein, IFI 16, is a repressor of transcription. J. Biol. Chem. 273: 17172—17177. PMID 9642285 doi:10.1074/jbc.273.27.17172

Див. також

• Хромосома 1