HOXA11

HOXA11
Ідентифікатори
Символи	HOXA11, HOX1, HOX1I, RUSAT1, homeobox A11
Зовнішні ІД	OMIM: 142958 MGI: 96172 HomoloGene: 4033 GeneCards: HOXA11
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription regulator complex • protein-DNA complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis • skeletal system development • proximal/distal pattern formation • regulation of chondrocyte differentiation • male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • organ induction • anatomical structure morphogenesis • embryonic digit morphogenesis • transcription, DNA-templated • single fertilization • uterus development • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • branching involved in ureteric bud morphogenesis • developmental growth • embryonic limb morphogenesis • positive regulation of chondrocyte differentiation • Сперматогенез • positive regulation of cell development • регуляція експресії генів • embryonic skeletal joint morphogenesis • metanephros development • mesodermal cell fate specification • dorsal/ventral pattern formation • embryonic forelimb morphogenesis • anterior/posterior pattern specification • bone development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3207	15396
Ensembl	ENSG00000005073	ENSMUSG00000038210
UniProt	P31270	P31311
RefSeq (мРНК)	NM_005523	NM_010450
RefSeq (білок)	NP_005514	NP_034580
Локус (UCSC)	Хр. 7: 27.18 – 27.19 Mb	Хр. 6: 52.22 – 52.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXA11 (англ. Homeobox A11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 34 486.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFDERGPCS		SNMYLPSCTY		YVSGPDFSSL		PSFLPQTPSS		RPMTYSYSSN
LPQVQPVREV		TFREYAIEPA		TKWHPRGNLA		HCYSAEELVH		RDCLQAPSAA
GVPGDVLAKS		SANVYHHPTP		AVSSNFYSTV		GRNGVLPQAF		DQFFETAYGT
PENLASSDYP		GDKSAEKGPP		AATATSAAAA		AAATGAPATS		SSDSGGGGGC
RETAAAAEEK		ERRRRPESSS		SPESSSGHTE		DKAGGSSGQR		TRKKRCPYTK
YQIRELEREF		FFSVYINKEK		RLQLSRMLNL		TDRQVKIWFQ		NRRMKEKKIN
RDRLQYYSAN		PLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Potter S.S., Branford W.W. (1998). Evolutionary conservation and tissue-specific processing of hoxa 11 antisense transcripts. Mamm. Genome. 9: 799—806. PMID 9745033 doi:10.1007/s003359900870
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Thompson A.A., Nguyen L.T. (2000). Amegakaryocytic thrombocytopenia and radio-ulnar synostosis are associated with HOXA11 mutation. Nat. Genet. 26: 397—398. PMID 11101832 doi:10.1038/82511

Див. також

• Хромосома 7