GLI1

GLI1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2GLI, 4BLB, 4KMD
Ідентифікатори
Символи	GLI1, GLI, GLI family zinc finger 1, PAPA8, PPD1
Зовнішні ІД	OMIM: 165220 MGI: 95727 HomoloGene: 3859 GeneCards: GLI1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • microtubule binding; • chromatin binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • війка; • нуклеоплазма; • ciliary base; • ciliary tip; • GO:0035085 Аксонема; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• epidermal cell differentiation; • proximal/distal pattern formation; • диференціація клітин; • pituitary gland development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of smoothened signaling pathway; • lung development; • positive regulation of cell migration; • smoothened signaling pathway involved in regulation of cerebellar granule cell precursor cell proliferation; • notochord regression; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • positive regulation of DNA replication; • ventral midline development; • multicellular organism development; • regulation of smoothened signaling pathway; • liver regeneration; • response to wounding; • regulation of osteoblast differentiation; • osteoblast differentiation; • Сперматогенез; • positive regulation of cell population proliferation; • cerebellar cortex morphogenesis; • regulation of hepatocyte proliferation; • canonical Wnt signaling pathway; • smoothened signaling pathway; • dorsal/ventral pattern formation; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • digestive tract morphogenesis; • prostate gland development; • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation; • positive regulation of cell cycle G1/S phase transition;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	2735
	14632
	ENSG00000111087
	ENSMUSG00000025407
	P08151
	P47806
	NM_001160045; NM_001167609; NM_005269
	NM_010296
	NP_001153517; NP_001161081; NP_005260
	NP_034426
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GLI1 (англ. GLI family zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 106 амінокислот, а молекулярна маса — 117 904^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFNSMTPPPI	SSYGEPCCLR	PLPSQGAPSV	GTEGLSGPPF	CHQANLMSGP
HSYGPARETN	SCTEGPLFSS	PRSAVKLTKK	RALSISPLSD	ASLDLQTVIR
TSPSSLVAFI	NSRCTSPGGS	YGHLSIGTMS	PSLGFPAQMN	HQKGPSPSFG
VQPCGPHDSA	RGGMIPHPQS	RGPFPTCQLK	SELDMLVGKC	REEPLEGDMS
SPNSTGIQDP	LLGMLDGRED	LEREEKREPE	SVYETDCRWD	GCSQEFDSQE
QLVHHINSEH	IHGERKEFVC	HWGGCSRELR	PFKAQYMLVV	HMRRHTGEKP
HKCTFEGCRK	SYSRLENLKT	HLRSHTGEKP	YMCEHEGCSK	AFSNASDRAK
HQNRTHSNEK	PYVCKLPGCT	KRYTDPSSLR	KHVKTVHGPD	AHVTKRHRGD
GPLPRAPSIS	TVEPKREREG	GPIREESRLT	VPEGAMKPQP	SPGAQSSCSS
DHSPAGSAAN	TDSGVEMTGN	AGGSTEDLSS	LDEGPCIAGT	GLSTLRRLEN
LRLDQLHQLR	PIGTRGLKLP	SLSHTGTTVS	RRVGPPVSLE	RRSSSSSSIS
SAYTVSRRSS	LASPFPPGSP	PENGASSLPG	LMPAQHYLLR	ARYASARGGG
TSPTAASSLD	RIGGLPMPPW	RSRAEYPGYN	PNAGVTRRAS	DPAQAADRPA
PARVQRFKSL	GCVHTPPTVA	GGGQNFDPYL	PTSVYSPQPP	SITENAAMDA
RGLQEEPEVG	TSMVGSGLNP	YMDFPPTDTL	GYGGPEGAAA	EPYGARGPGS
LPLGPGPPTN	YGPNPCPQQA	SYPDPTQETW	GEFPSHSGLY	PGPKALGGTY
SQCPRLEHYG	QVQVKPEQGC	PVGSDSTGLA	PCLNAHPSEG	PPHPQPLFSH
YPQPSPPQYL	QSGPYTQPPP	DYLPSEPRPC	LDFDSPTHST	GQLKAQLVCN
YVQSQQELLW	EGGGREDAPA	QEPSYQSPKF	LGGSQVSPSR	AKAPVNTYGP
GFGPNLPNHK	SGSYPTPSPC	HENFVVGANR	ASHRAAAPPR	LLPPLPTCYG
PLKVGGTNPS	CGHPEVGRLG	GGPALYPPPE	GQVCNPLDSL	DLDNTQLDFV
AILDEPQGLS	PPPSHDQRGS	SGHTPPPSGP	PNMAVGNMSV	LLRSLPGETE
FLNSSA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Kinzler K.W., Ruppert J.M., Bigner S.H., Vogelstein B. (1988). The GLI gene is a member of the Kruppel family of zinc finger proteins. Nature. 332: 371—374. PMID 2832761 doi:10.1038/332371a0
Lo H.W., Zhu H., Cao X., Aldrich A., Ali-Osman F. (2009). A novel splice variant of GLI1 that promotes glioblastoma cell migration and invasion. Cancer Res. 69: 6790—6798. PMID 19706761 doi:10.1158/0008-5472.CAN-09-0886
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Kinzler K.W., Vogelstein B. (1990). The GLI gene encodes a nuclear protein which binds specific sequences in the human genome. Mol. Cell. Biol. 10: 634—642. PMID 2105456 doi:10.1128/MCB.10.2.634
Koyabu Y., Nakata K., Mizugishi K., Aruga J., Mikoshiba K. (2001). Physical and functional interactions between Zic and Gli proteins. J. Biol. Chem. 276: 6889—6892. PMID 11238441 doi:10.1074/jbc.C000773200
Maloverjan A., Piirsoo M., Michelson P., Kogerman P., Osterlund T. (2010). Identification of a novel serine/threonine kinase ULK3 as a positive regulator of Hedgehog pathway. Exp. Cell Res. 316: 627—637. PMID 19878745 doi:10.1016/j.yexcr.2009.10.018

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4317 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-07-27 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P08151 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4317 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-07-27 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P08151 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]