/* Como eu posso mutar um residuo? */

Rahbr · andreasprlic · commit fb9d71c819c1 · 2016-03-18T23:27:37.000-07:00
diff --git a/wiki/BioJava:CookbookPortuguese:PDB:mutate.md b/wiki/BioJava:CookbookPortuguese:PDB:mutate.md
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+---
+title: BioJava:CookbookPortuguese:PDB:mutate
+---
+
+### Como eu posso mutar um residuo?
+
+<java>
+
+`// mutar uma estrutura de proteina`  
+`// e salvar para arquivo`  
+  
+`String filename   =  "5pti.pdb" ;`  
+`String outputfile =  "mutated.pdb" ;`  
+  
+`PDBFileReader pdbreader = new PDBFileReader();`  
+  
+`try{`  
+`    Structure struc = pdbreader.getStructure(filename);`  
+`    System.out.println(struc);`  
+  
+  
+`    String chainId = " ";`  
+`    String pdbResnum = "3";`  
+`    String newType = "ARG";`  
+  
+`    // muta a estrutura original e cria uma nova.`  
+`    // deixa ponto de corrente lateral na mesma direção, mas só usa átomo Cb`  
+`     Mutator m = new Mutator();`
+
+`     Structure newstruc = m.mutate(struc,chainId,pdbResnum,newType);`  
+` `  
+`     FileOutputStream out= new FileOutputStream(outputfile); `  
+`     PrintStream p =  new PrintStream( out );`  
+` `  
+`     p.println (newstruc.toPDB());`  
+` `  
+`     p.close();`  
+` `  
+` `  
+` } catch (Exception e) {`  
+`     e.printStackTrace();`  
+` } `
+
+</java>
diff --git a/wiki/BioJava:CookbookPortuguese:PDB:mutate.mediawiki b/wiki/BioJava:CookbookPortuguese:PDB:mutate.mediawiki
@@ -0,0 +1,38 @@
+=== Como eu posso mutar um residuo? ===
+
+<java>
+ // mutar uma estrutura de proteina
+ // e salvar para arquivo
+ 
+ String filename   =  "5pti.pdb" ;
+ String outputfile =  "mutated.pdb" ;
+ 
+ PDBFileReader pdbreader = new PDBFileReader();
+ 
+ try{
+     Structure struc = pdbreader.getStructure(filename);
+     System.out.println(struc);
+ 
+ 
+     String chainId = " ";
+     String pdbResnum = "3";
+     String newType = "ARG";
+ 
+     // muta a estrutura original e cria uma nova.
+     // deixa ponto de corrente lateral na mesma direção, mas só usa átomo Cb
+      Mutator m = new Mutator();
+
+      Structure newstruc = m.mutate(struc,chainId,pdbResnum,newType);
+  
+      FileOutputStream out= new FileOutputStream(outputfile); 
+      PrintStream p =  new PrintStream( out );
+  
+      p.println (newstruc.toPDB());
+  
+      p.close();
+  
+  
+  } catch (Exception e) {
+      e.printStackTrace();
+  } 
+</java>
