Zum Inhalt springen

Liste von sequenzierten Genomen

aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Backhefe
Der Fadenwurm Caenorhabditis elegans unter dem Mikroskop.

Diese Liste von sequenzierten Genomen umfasst Genome der Eukaryoten - Lebewesen mit - und Prokaryoten - Lebewesen ohne Zellkern - als auch ihrer Viren, deren Genom vollständig sequenziert wurden.

Das kleine zirkuläre und einzelsträngige DNS-Genom (sscccDNA) des φX174 Bakteriophagen von nur wenigen tausend Nukleotiden (5386 Basenpaare, bp) wurde erstmals 1977 von Frederick Sanger sequenziert, welches bedeutet, dass seine Nukleotidsequenz mit Hilfe von Sanger-DNS-Sequenzierung erstmalig vollständig ermittelt werden konnte. Nach und nach wurde die DNS von ganzen Chromosomen und Genomen komplexer Lebewesen sequenziert. Die erste Sequenzierung des vollständigen Genoms eines Lebewesens gelang 1995 mit dem Bakterium Haemophilus influenzae. Die so ermittelten Basensequenzen werden über das Internet, unter anderem vom NCBI, bereitgestellt.

1996 wurde mit der Backhefe (Saccharomyces cerevisiae), die zu den Pilzen gehört, das erste Genom eines Eukaryonten veröffentlicht und 1998 wurde mit dem zu den Tieren gehörenden Fadenwurm Caenorhabditis elegans das erste Genom eines Mehrzellers veröffentlicht.

Die Forschung konzentrierte sich zunächst auf die Sequenzierung von Organismen, die entweder für die Grundlagenforschung oder die für die anwendungsorientierte, medizinisch-pharmazeutische Forschung von besonderem Interesse sind. Solche eukariontische Organismen sind in dieser Liste zu finden. Mit dem Fortschritt der Technik wurde die Sequenzierung immer schneller, einfacher und somit auch günstiger, so dass inzwischen das Genom von über 50.000 (Stand: 2020) verschiedenen Organismen analysiert werden konnte.

Die Sequenz von Genen und Genomen kann genutzt werden um Konservierung dieser festzustellen und basierend darauf die physiologischen Wichtigkeit einiger Gene und deren RNSn und Proteinen als auch relative Alter der Gene und somit der Spezies zu klären.[1]

Die Genome eukaryotisches Lebens sind für human-zentrierte Forschung besonders notwendig, da der Mensch selber Teil dieser Domäne ist.

Aufgelistet sind die fünf Pilze, deren Genom zuerst sequenziert wurde.

Organismus Typ Relevanz Größe des Genoms vorhergesagte Anzahl von Genen Organisation Jahr der Sequenzierung Bild
Saccharomyces cerevisiae
Strain:S288C
Backhefe Backhefe; Modellorganismus Eukaryont 12.1 Mb 6 294[2] International Collaboration for the Yeast Genome Sequencing[3] 1996[2]
Encephalitozoon cuniculi Microsporidium Humanpathogen 2.9 Mb 1 997[4] Genoscope und Université Blaise Pascal 2001[4]
Schizosaccharomyces pombe
Strain:972h-
Spalthefen Modellorganismus Eukaryont 14 Mb 4 824[5] Sanger Institute und Cold Spring Harbor Laboratory 2002[5]
Neurospora crassa Sordariomycetes Modellorganismus Eukaryont 40 Mb 10 082[6] Broad Institute, Oregon Health, Science University, University of Kentucky und die University of Kansas 2003[6]
Phanerochaete chrysosporium
Strain:RP78
Stielporlingsartiger Holzpilz für Verrottung, wird für Bioremediation verwendet 30 Mb 11 777[7] Joint Genome Institute 2004[7]

Animalia - Tiere

[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Aufgelistet sind die vier Tiere, deren Genom zuerst sequenziert wurde. Außerdem sind Säugetiere, deren Genom vor 2010 sequenziert wurde und weitere wichtige Modellorganismen in die Liste aufgenommen.

Organismus Typ Relevanz Größe des Genoms vorhergesagte Anzahl von Genen Organisation / Bemerkung Jahr der Sequenzierung Bild
Caenorhabditis elegans
Strain:Bristol N2
Nematode Modellorganismus Tier 100 Mb 19 000[8] Washington University und das Sanger Institute 1998[8]
Drosophila melanogaster Fruchtfliege Modellorganismus Tier 165 Mb 13 600[9] Celera, UC Berkeley, Baylor College of Medicine, European DGP 2000[9]
Homo sapiens Primaten Mensch 3.2 Gb[10] 18 826 (CCDS consortium) Human Genome Project Consortium und Celera Genomics Entwurf 2001[11][12]
Vollständig 2006[13]
Anopheles gambiae
Strain: PEST
Stechmücke Verbreitung von Malaria 278 Mb 13 683[14] Celera Genomics und Genoscope 2002[14]
Takifugu rubripes Kugelfisch Wirbeltier mit kleinem Genom, japanischer Kugelfisch 390 Mb 22 000 – 29 000[15] International Fugu Genome Consortium 2002[16]
Mus musculus
Strain: C57BL/6J
Nagetiere Hausmaus ca. 3 Gb 24 000 2002[17][18]
Rattus norvegicus Nagetiere Wanderratte 2.8 Gb Entwurf 2004[19]
Pan troglodytes Primaten Schimpanse 3.3 Gb 2005[20][21]
Canis familiaris Canidae Haushund 2.5 Gb 19 300 2005[22][23]
Ornithorhynchus anatinus Säugetier Schnabeltier 1.9 Gb 18 600 Entwurf 2007,[24]

vollständig 2021[25]

Monodelphis domestica Beuteltiere Haus-Spitzmausbeutelratte 18 000–20 000 Gene[26] MIT und Harvard 2007[27]
Macaca mulatta Primaten Rhesusaffe 3.1 Gb 30 000 2007[28][29]
Felis catus Felidae Hauskatze 2.7 Gb 20 000 2007[30]
Wollhaarmammut Elephantidae Erste Sequenzierung des Genoms einer ausgestorbenen Tierart. > 4Gb 2008 rund 70 Prozent der Erbinformation entschlüsselt, 2015 komplettes Genom[31] 2008[32]
Loxodonta africana Elephantidae Afrikanischer Elefant 2009[33]
Equus caballus Unpaarhufer Hauspferd 2.5 Gb 2009[34][35][36]
Bos primigenius taurus Paarhufer Hausrind 2.7 Gb[37] 22 000.[38] National Institutes of Health und das US Department of Agriculture 2009[39]
Danio rerio Cypriniformes Zebrafisch,
Modellorganismus Tier
1.5 Gb[40] 26 000[41] 2013[41]
Xenopus laevis Anura Krallenfrosch, historischer Modellorganismus für embryonale Entwicklung 2.7 Gb[42] 44 456[42] 2021[42]

Plantae - Pflanzen

[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Aufgelistet sind die drei Pflanzen, deren Genome zuerst sequenziert wurden.

Organism Typ Relevanz Größe des Genoms Anzahl Chromosomen vorhergesagte Anzahl von Genen Organisation Jahr der Sequenzierung Bild
Arabidopsis thaliana
Ecotype:Columbia
Kreuzblütlerartige, Acker-Schmalwand Modellorganismus, Unkraut 135 Mb[43] 5 25 498,[44] Arabidopsis Genome Initiative[45] 2000[44]
Acker-Schmalwand
Acker-Schmalwand
Oryza sativa
ssp indica
Süßgrasartige, Reis Feldfrucht und Modellorganismus 420 Mb 12 32 000–50 000[46] Beijing Genomics Institute, Zhejiang University und Chinese Academy of Sciences 2002[46]
Westliche Balsam-Pappel Malpighienartige, Pappel Kohlenstoffsenke, Modellorganismus Baum, Nutz-Holzart und Vergleich mit A. thaliana 550 Mb 19 45 555[47] The International Poplar Genome Consortium 2006[47]

Archaeplastida Algen

[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Aufgelistet sind die beiden archaeplastida Algen, deren Genome zuerst sequenziert wurden.

Organism Typ Relevanz Größe des Genoms Anzahl Chromosomen vorhergesagte Anzahl von Genen Organisation Jahr der Sequenzierung Bild
Cyanidioschyzon merolae
Strain:10D
Rotalge einfacher Eukaryont 16.5 Mb 20 5 331[48] University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University und Kumamoto University 2004[48]
Ostreococcus tauri Grünalge einfacher Eukaryont, kleines Genom 12.6 Mb 20 7 969 (UniProt) Laboratoire Arago 2006[49]

Protisten der SAR, Excavata und Pancryptista Kladden

[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Protisten sind eine historische Kladde hochdiverser eukaryotischer mono- (ein-) oder selten oligo- (wenig-)zellulärer Spezies aus verschiedenen modernen Reichen.[50] Die moderne Taxonomie beruht auf genetischem Konservatismus, welches hauptsächlich durch Genom-Sequenzierung ermöglicht wurde. Mitunter aufgrund der Abstammung des multizellulären Lebens von dieser Kladde ist das Verständnis protistischer Genome notwendig, sowohl zur evolutionsbiologischen Aufklärung als auch zur Feststellung von Konservation spezifischer Nukleotidsequenzen als auch biochemischer Funktionen.[51]

Aufgelistet sind die neun nicht-archaeplastida Protisten, deren Genom zuerst sequenziert wurden.

Organismus Typ Relevanz Größe des Genoms vorhergesagte Anzahl von Genen Organisation Jahr der Sequenzierung Bild
Guillardia theta Cryptomonad Modellorganismus 551 kbp
nucleomorph
(nur das Genom)
465[52] Canadian Institute of Advanced Research, Philipps-University Marburg und die University of British Columbia 2001[52]
Plasmodium falciparum
Clone:3D7
Apicomplexa Humanpathogen (Malaria) 22.9 Mb 5 268[53] Malaria Genome Project Consortium 2002[53]
Plasmodium yoelii yoelii
Strain:17XNL
Apicomplexa Nagetier-Pathogen (Malaria) 23.1 Mb 5 878[54] TIGR und NMRC 2002[54]
Cryptosporidium hominis
Strain:TU502
Apicomplexa Humanpathogen (Durchfall) 10.4 Mb 3 994[55] Virginia Commonwealth University 2004[55]
Cryptosporidium parvum
C- or genotype 2 isolate
Apicomplexa Humanpathogen (Durchfall) 16.5 Mb 3 807[56] UCSF und University of Minnesota 2004[56]
Thalassiosira pseudonana
Strain:CCMP 1335
Diatom Modellorganismus Kieselalge 34.5 Mb 11 242[57] Joint Genome Institute und die University of Washington 2004[57]
Trypanosoma cruzi
Strain:CL-Brener
Kinetoplastid Humanpathogen (Chagas) 67 Mb 22 570[58] The Institute for Genome Research (TIGR), Karolinska Institutet (KI) und Seattle Biomedical Research Institute (SBRI) 2005[58]
Trypanosoma brucei
Clone:TREU 927/4
Kinetoplastid Humanpathogen (Schlafkrankheit) 26 Mb 9 068[59] Wellcome Trust Sanger Institute und The Institute for Genome Research (TIGR) 2005[59]
Leishmania major
Strain: Friedlin
Kinetoplastid Humanpathogen (Orientbeule) 32.8 Mb 8 272[60] Wellcome Trust Sanger Institute und Seattle Biomedical Research Institute (SBRI) 2005[60]

Prokaryota - Prokaryoten

[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Im Folgenden werden wichtige sequenzierte prokaryotische Genome, aufgespalten auf die beiden untergeordneten Domäne aufgelistet.

Bacteria - Bakterien

[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Im Folgenden werden wichtige sequenzierte Bakterien Genome aufgelistet.

Spezies Strang Familie Interesse Chromosomengröße Plasmide Plasmidgröße Protein-Sequenzen Stand Projekt
Escherichia coli K-12/MG1655 Enterobacteriaceae Modellorganismus gramnegativer Bakterien, Darmflora Mensch

(Viele weitere Stränge sequenziert)

4.6 Mb 0 / 4300 2025 E. coli Genome Project (GSGSC-UW)

PRJNA57779

Yersinia pestis KIM10+ Yersiniaceae (Ordnung: Enterobacterales) Erreger der Pestilenz, größte pandemische Krankheit der festgehaltenen menschlichen Geschichte 4.6 Mb 1 101.0 kb (pMT-1) 4205 2002 GSGSC-UW

NIH-Med

Salmonella Typhi Ty2 Enterobacterales Erreger der Abdominaltyphus 4.8 Mb 0 / 2003 GSGSC-UW
Shigella flexneri 2a 2457T Enterobacteriaceae Erreger der Dysenterie 4.6 Mb 0 / 4068 2003 GSGSC-UW

NIH-Med

Mycobacterium tuberculosis HN-024/MG1655 Mycobacteriaceae 'Wichtigster' Erreger der Tuberkulose beim Menschen 4.4 Mb 0 / 4027 2017 NIH-Med
Haemophilus influenzae PittGG Pasteurellaceae Schleimhautflora Mensch & Krankheitserreger 1.9 Mb 0 / 1667 2007 NIH-Med
Streptomyces coelicolor A3(2) Streptomycetaceae Modellorganismus aus Bodenproben 8.7 Mb 2 356.0 kb (SCP1)

31.3 kb (SCP2)

8154 2003 NIH-Med
Helicobacter pylori 26695 Helicobacteraceae Erreger einiger Magenerkrankungen des Menschen 1.7 Mb 0 / 1594 2012 NIH-Med
"Aquifex aeolicus" VF5 Aquificaceae Einer von nur wenigen bekannten Vertretern des Aquificota-Stammes 1.6 Mb 1 39.5 kb 1553 2003 NIH-Med
Thermotoga

maritima

MSB8 Thermotogaceae (Stamm: Thermotogota) Einziges bekanntes fermentatives Bakterium, welches nutzbaren Wasserstoff über dem Thauer Limit freisetzt 1.9 Mb 0 / 1871 2013 NIH-Med

Archaea - Archaeen

[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Im Folgenden werden wichtige sequenzierte Archaeen Genome aufgelistet.

Spezies Strang Familie Interesse Chromosomengröße Plasmide Plasmidgröße Protein-Sequenzen Stand Projekt
Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 Methanocaldococcaceae Vermutlich erstes sequenziertes Archaeen-Genom 1.7 Mb 2 58.4 kb (pDSM2661_1)

16.6 kb (pDSM2661_2)

1770 1996 NIH-Med
Archaeoglobus fulgidus DSM4304 Archaeoglobaceae früh sequenziertes Archaeum 2.2 Mb 0 / 2407 2003

(1997)

NIH-Med
Pyrococcus horikoshii OT3 Thermococcaceae früh sequenziertes Archaeum 1.7 Mb 0 / 1857 Proteine vermutet

(von 1943 Genen)

1998 NIH-Med
Aeropyrum pernix K1 Acidilobaceae (Klasse:Thermoprotei) früh sequenziertes Archaeum 1.7 Mb 0 / 1704 Proteine vermutet

(von 1763 Genen)

1999 NIH-Med
Pyrococcus furiosus DSM 3638 Thermococcaceae früh sequenziertes Archaeum 1.9 Mb 0 / 2065 2001

(1999)

NIH-Med
Promethearchaeia archaeon unk. Lokiarchaeen s. s.

(Promethearchaeaceae)

Loki-Asgard Archaeum, ehemals angenommen nächsten Verwandten zu Eukaryoten

(jetzt nach Heimdallarchaeia)

2.8 Mb unk. unk. 2627 2025 NIH-Med(MAG)NCBI-Tax
Candidatus Freyarchaeum deiterrae unk. Freyarchaeaceae Asgard Archaeum, Evolutionsbiologisches Interesse 3.8 Mb unk. unk. 3272 2025 NIH-Med(MAG)NCBI-Tax

Einzelnachweise

[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
  1. Alberts, B.; Heald, R.; Johnson, A.; Lewis, J.; et al.: Molekularbiologie der Zelle. 7. Auflage. Wiley-VCH., Weinheim, Deutschland 2025, ISBN 978-3-527-35364-4.
  2. a b Goffeau A, Barrell BG, Bussey H, R. W. Davis, B. Dujon, H. Feldmann, F. Galibert, J. D. Hoheisel, C. Jacq, M. Johnston, E. J. Louis, H. W. Mewes, Y. Murakami, P. Philippsen, H. Tettelin, S. G. Oliver: Life with 6000 genes. In: Science. 274. Jahrgang, Nr. 5287, Oktober 1996, S. 546, 563–7, doi:10.1126/science.274.5287.546, PMID 8849441, bibcode:1996Sci...274..546G (englisch).
  3. International Collaboration for the Yeast Genome Sequencing (Memento vom 27. September 2007 im Internet Archive)
  4. a b Katinka MD, Duprat S, Cornillot E, Guy Méténier, Fabienne Thomarat, Gérard Prensier, Valérie Barbe, Eric Peyretaillade, Philippe Brottier: Genome sequence and gene compaction of the eukaryote parasite Encephalitozoon cuniculi. In: Nature. 414. Jahrgang, Nr. 6862, November 2001, S. 450–3, doi:10.1038/35106579, PMID 11719806, bibcode:2001Natur.414..450K (englisch).
  5. a b Wood V, Gwilliam R, Rajandream MA, M. Lyne, R. Lyne, A. Stewart, J. Sgouros, N. Peat, J. Hayles: The genome sequence of Schizosaccharomyces pombe. In: Nature. 415. Jahrgang, Nr. 6874, Februar 2002, S. 871–80, doi:10.1038/nature724, PMID 11859360 (englisch).
  6. a b Galagan JE, Calvo SE, Borkovich KA, Eric U. Selker, Nick D. Read, David Jaffe, William Fitzhugh, Li-Jun Ma, Serge Smirnov, Seth Purcell, Bushra Rehman, Timothy Elkins, Reinhard Engels, Shunguang Wang, Cydney B. Nielsen, Jonathan Butler, Matthew Endrizzi, Dayong Qui, Peter Ianakiev, Deborah Bell-Pedersen, Mary Anne Nelson, Margaret Werner-Washburne, Claude P. Selitrennikoff, John A. Kinsey, Edward L. Braun, Alex Zelter, Ulrich Schulte, Gregory O. Kothe, Gregory Jedd, Werner Mewes: The genome sequence of the filamentous fungus Neurospora crassa. In: Nature. 422. Jahrgang, Nr. 6934, April 2003, S. 859–68, doi:10.1038/nature01554, PMID 12712197, bibcode:2003Natur.422..859G (englisch).
  7. a b Diego Martinez, Luis F Larrondo, Nik Putnam, Maarten D Sollewijn Gelpke, Katherine Huang, Jarrod Chapman, Kevin G Helfenbein, Preethi Ramaiya, J Chris Detter, Frank Larimer, Pedro M Coutinho, Bernard Henrissat, Randy Berka, Dan Cullen, Daniel Rokhsar: Genome sequence of the lignocellulose degrading fungus Phanerochaete chrysosporium strain RP78. In: Nature Biotechnology. 22. Jahrgang, Nr. 6, 2004, S. 695–700, doi:10.1038/nbt967, PMID 15122302 (englisch).
  8. a b C. elegans Sequencing Consortium: Genome sequence of the nematode C. elegans: a platform for investigating biology. In: Science. 282. Jahrgang, Nr. 5396, Dezember 1998, S. 2012–8, doi:10.1126/science.282.5396.2012, PMID 9851916, bibcode:1998Sci...282.2012. (englisch).
  9. a b Adams MD, Celniker SE, Holt RA, CA Evans, JD Gocayne, PG Amanatides, SE Scherer, PW Li, RA Hoskins: The genome sequence of Drosophila melanogaster. In: Science. 287. Jahrgang, Nr. 5461, März 2000, S. 2185–95, doi:10.1126/science.287.5461.2185, PMID 10731132, bibcode:2000Sci...287.2185. (englisch).
  10. Human Genome Sequencing Consortium, International: Finishing the euchromatic sequence of the human genome. In: Nature. 431. Jahrgang, Nr. 7011, Oktober 2004, S. 931–45, doi:10.1038/nature03001, PMID 15496913, bibcode:2004Natur.431..931H (englisch).
  11. McPherson JD, Marra M, Hillier L, Robert H. Waterston, Asif Chinwalla, John Wallis, Mandeep Sekhon, Kristine Wylie, Elaine R. Mardis: A physical map of the human genome. In: Nature. 409. Jahrgang, Nr. 6822, Februar 2001, S. 934–41, doi:10.1038/35057157, PMID 11237014, bibcode:2001Natur.409..934M (englisch).
  12. Venter JC, Adams MD, Myers EW, PW Li, RJ Mural, GG Sutton, HO Smith, M Yandell, CA Evans, Robert A. Holt, Jeannine D. Gocayne, Peter Amanatides, Richard M. Ballew, Daniel H. Huson, Jennifer Russo Wortman, Qing Zhang, Chinnappa D. Kodira, Xiangqun H. Zheng, Lin Chen, Marian Skupski, Gangadharan Subramanian, Paul D. Thomas, Jinghui Zhang, George L. Gabor Miklos, Catherine Nelson, Samuel Broder, Andrew G. Clark, Joe Nadeau, Victor A. McKusick, Norton Zinder: The sequence of the human genome. In: Science. 291. Jahrgang, Nr. 5507, Februar 2001, S. 1304–51, doi:10.1126/science.1058040, PMID 11181995, bibcode:2001Sci...291.1304V (englisch).
  13. Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, R. Kaul, D. Swarbreck, A. Dunham, C. E. Scott, K. L. Howe, K. Woodfine, C. C. A. Spencer, M. C. Jones, C. Gillson, S. Searle, Y. Zhou, F. Kokocinski, L. McDonald, R. Evans, K. Phillips, A. Atkinson, R. Cooper, C. Jones, R. E. Hall, T. D. Andrews, C. Lloyd, R. Ainscough, J. P. Almeida, K. D. Ambrose, F. Anderson, R. W. Andrew, R. I. S. Ashwell: The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1. In: Nature. 441. Jahrgang, Nr. 7091, Mai 2006, S. 315–21, doi:10.1038/nature04727, PMID 16710414, bibcode:2006Natur.441..315G (englisch).
  14. a b Holt RA, Subramanian GM, Halpern A, GG Sutton, R Charlab, DR Nusskern, P Wincker, AG Clark, JM Ribeiro, Ron Wides, Steven L. Salzberg, Brendan Loftus, Mark Yandell, William H. Majoros, Douglas B. Rusch, Zhongwu Lai, Cheryl L. Kraft, Josep F. Abril, Veronique Anthouard, Peter Arensburger, Peter W. Atkinson, Holly Baden, Veronique De Berardinis, Danita Baldwin, Vladimir Benes, Jim Biedler, Claudia Blass, Randall Bolanos, Didier Boscus, Mary Barnstead: The genome sequence of the malaria mosquito Anopheles gambiae. In: Science. 298. Jahrgang, Nr. 5591, Oktober 2002, S. 129–49, doi:10.1126/science.1076181, PMID 12364791, bibcode:2002Sci...298..129H (englisch).
  15. International Fugu Genome Consortium. Forth Genome Assembly (Memento vom 5. Februar 2012 im Internet Archive)
  16. Aparicio S, Chapman J, Stupka E, N Putnam, JM Chia, P Dehal, A Christoffels, S Rash, S Hoon, Arian Smit, Maarten D. Sollewijn Gelpke, Jared Roach, Tania Oh, Isaac Y. Ho, Marie Wong, Chris Detter, Frans Verhoef, Paul Predki, Alice Tay, Susan Lucas, Paul Richardson, Sarah F. Smith, Melody S. Clark, Yvonne J. K. Edwards, Norman Doggett, Andrey Zharkikh, Sean V. Tavtigian, Dmitry Pruss, Mary Barnstead, Cheryl Evans: Whole-genome shotgun assembly and analysis of the genome of Fugu rubripes. In: Science. 297. Jahrgang, Nr. 5585, August 2002, S. 1301–10, doi:10.1126/science.1072104, PMID 12142439, bibcode:2002Sci...297.1301A (englisch).
  17. Waterston RH, Lindblad-Toh K, Birney E, et al.: Initial sequencing and comparative analysis of the mouse genome. In: Nature. 420. Jahrgang, Nr. 6915, Dezember 2002, S. 520–62, doi:10.1038/nature01262, PMID 12466850 (englisch).
    Pierre L. Roubertoux et al.: From DNA to mind. In: EMBO Reports. Juli 2007, Band 8 (S1): S7–S11, doi:10.1038/sj.embor.7400991
  18. MapViewer Eintrag.
  19. R. A. Gibbs, G. M. Weinstock, M. L. Metzker u. a.: Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution. In: Nature. Band 428, Nr. 6982, April 2004, S. 493–521, doi:10.1038/nature02426, PMID 15057822.
  20. MapViewer Eintrag
  21. Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome. In: Nature. 437. Jahrgang, Nr. 7055, September 2005, S. 69–87, doi:10.1038/nature04072, PMID 16136131 (englisch).
  22. MapView Eintrag
  23. K. Lindblad-Toh, C.M. Wade, T.S. Mikkelsen u. a.: Genome sequence, comparative analysis and haplotype structure of the domestic dog. In: Nature. 438. Jahrgang, Nr. 7069, Dezember 2005, S. 803–819, doi:10.1038/nature04338, PMID 16341006 (englisch).
  24. Warren, Wesley C.; Hillier, Ladeana W.; Marshall Graves, Jennifer A.; Birney, Ewan; Ponting, Chris P.; Grützner, Frank; Belov, Katherine; Miller, Webb; Clarke, Laura; Chinwalla, Asif T.; Yang, Shiaw-Pyng; Heger, Andreas; Locke, Devin P.; Miethke, Pat; Waters, Paul D.; Veyrunes, Frédéric; Fulton, Lucinda; Fulton, Bob; Graves, Tina; Wallis, John;: Genome analysis of the platypus reveals unique signatures of evolution. In: Nature. 453. Jahrgang, Nr. 7192, Mai 2008, S. 175–83, doi:10.1038/nature06936, PMID 18464734, PMC 2803040 (freier Volltext), bibcode:2008Natur.453..175W (englisch).
  25. Y. Zhou et al. Platypus and echidna genomes reveal mammalian biology and evolution. Nature, online publiziert, 6. Januar 2021; doi:10.1038/s41586-020-03039-0
  26. Monodelphis_domestica, Ensembl genome browser 104
  27. Mikkelsen TS, Wakefield MJ, Aken B, Amemiya CT, Chang JL, Duke S, Garber M, Gentles AJ, Goodstadt L, Heger A, Jurka J, Kamal M, Mauceli E, Searle SM, Sharpe T, Baker ML, Batzer MA, Benos PV, Belov K, Clamp M, Cook A, Cuff J, Das R, Davidow L, Deakin JE, Fazzari MJ, Glass JL, Grabherr M, Greally JM, Gu W, Hore TA, Huttley GA, Kleber M, Jirtle RL, Koina E, Lee JT, Mahony S, Marra MA, Miller RD, Nicholls RD, Oda M, Papenfuss AT, Parra ZE, Pollock DD, Ray DA, Schein JE, Speed TP, Thompson K, VandeBerg JL, Wade CM, Walker JA, Waters PD, Webber C, Weidman JR, Xie X, Zody MC, Graves JA, Ponting CP, Breen M, Samollow PB, Lander ES, Lindblad-Toh K: Genome of the marsupial Monodelphis domestica reveals innovation in non-coding sequences. In: Nature. 447. Jahrgang, Nr. 7141, Mai 2007, S. 167–77, doi:10.1038/nature05805, PMID 17495919, bibcode:2007Natur.447..167M (englisch).
  28. MapViewer Eintrag
  29. Gibbs RA, Rogers J, Katze MG, et al.: Evolutionary and biomedical insights from the rhesus macaque genome. In: Science. 316. Jahrgang, Nr. 5822, April 2007, S. 222–34, doi:10.1126/science.1139247, PMID 17431167 (englisch).
  30. J. U. Pontius, J. C. Mullikin, D. R. Smith, K. Lindblad-Toh, S. Gnerre, M. Clamp, J. Chang, R. Stephens, B. Neelam, N. Volfovsky, A. A. Schäffer, R. Agarwala, K. Narfström, W. J. Murphy, U. Giger, A. L. Roca, A. Antunes, M. Menotti-Raymond, N. Yuhki, J. Pecon-Slattery, W. E. Johnson, G. Bourque, G. Tesler, S. J. O'B: Initial sequence and comparative analysis of the cat genome. In: Genome Research. Band 17, Nummer 11, November 2007, S. 1675–1689, ISSN 1088-9051. doi:10.1101/gr.6380007. PMID 17975172. PMC 2045150 (freier Volltext).
  31. Complete Genomes Reveal Signatures of Demographic and Genetic Declines in the Woolly Mammoth, Palkopoulou, Eleftheria et al., Current Biology, Volume 25, Issue 10, 1395–1400
  32. Webb Miller, Daniela I. Drautz, Aakrosh Ratan, Barbara Pusey, Ji Qi, Arthur M. Lesk, Lynn P. Tomsho, Michael D. Packard, Fangqing Zhao, Andrei Sher, Alexei Tikhonov, Brian Raney, Nick Patterson, Kerstin Lindblad-Toh, Eric S. Lander, James R. Knight, Gerard P. Irzyk, Karin M. Fredrikson, Timothy T. Harkins, Sharon Sheridan, Tom Pringle, Stephan C. Schuster: Sequencing the nuclear genome of the extinct woolly mammoth. In: Nature. 456, 2008, S. 387–390. (online)
  33. Loxodonta africana. In: UCSC browser entry. (englisch).
  34. MapView Eintrag
  35. Horse Genome Assembled. In: NIH News.
  36. C. M. Wade u. a.: Genome Sequence, Comparative Analysis, and Population Genetics of the Domestic Horse. In: Science. Band 326, Nr. 5954, 2009, S. 865–867. doi:10.1126/science.1178158
  37. David Brown: Scientists Unravel Genome of the Cow In: The Washington Post, 23. April 2009 (englisch). 
  38. Victoria Gill: BBC: Cow genome 'to transform farming' In: BBC News, 23. April 2009. Abgerufen am 15. Oktober 2013 (englisch). 
  39. Elsik, Christine G.; Tellam, Ross L.; Worley, Kim C.; Gibbs, Richard A.; Elsik, Christine G.; Tellam, Ross L.; Gibbs, Richard A.; Muzny, Donna M.; Weinstock, George M.; Adelson, David L.; Eichler, Evan E.; Elnitski, Laura; Elsik, Christine G.; Guigó, Roderic; Hamernik, Debora L.; Kappes, Steve M.; Lewin, Harris A.; Lynn, David J.; Nicholas, Frank W.: The genome sequence of taurine cattle: a window to ruminant biology and evolution. In: Science. 324. Jahrgang, Nr. 5926, April 2009, S. 522–8, doi:10.1126/science.1169588, PMID 19390049, PMC 2943200 (freier Volltext), bibcode:2009Sci...324..522A (englisch).
  40. Ralf Dahm, Robert Geisler, Christiane Nüsslein-Volhard: Zebrafish (Danio rerio) Genome and Genetics. In: Reviews in Cell Biology and Molecular Medicine. John Wiley & Sons, Ltd, 2006, ISBN 3-527-60090-6, doi:10.1002/3527600906.mcb.200400059 (wiley.com [abgerufen am 27. Oktober 2025]).
  41. a b Kerstin Howe, Matthew D. Clark, Carlos F. Torroja, James Torrance, Camille Berthelot, Matthieu Muffato, John E. Collins, Sean Humphray, Karen McLaren, Lucy Matthews, Stuart McLaren, Ian Sealy, Mario Caccamo, Carol Churcher, Carol Scott, Jeffrey C. Barrett, Romke Koch, Gerd-Jörg Rauch, Simon White, William Chow, Britt Kilian, Leonor T. Quintais, José A. Guerra-Assunção, Yi Zhou, …Derek L. Stemple: The zebrafish reference genome sequence and its relationship to the human genome. In: Nature. Band 496, Nr. 7446, April 2013, ISSN 1476-4687, S. 498–503, doi:10.1038/nature12111 (nature.com [abgerufen am 27. Oktober 2025]).
  42. a b c Xenopus laevis genome assembly Xenopus_laevis_v10.1. Abgerufen am 27. Oktober 2025 (englisch).
  43. TAIR - Genome Assembly. (englisch).
  44. a b The Arabidopsis Genome Initiative: Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana. In: Nature. 408. Jahrgang, Nr. 6814, Dezember 2000, S. 796–815, doi:10.1038/35048692, PMID 11130711, bibcode:2000Natur.408..796T (englisch).
  45. Arabidopsis Genome Initiative (Memento vom 7. Februar 2006 im Internet Archive)
  46. a b Goff SA, Ricke D, Lan TH, G Presting, R Wang, M Dunn, J Glazebrook, A Sessions, P Oeller: A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. japonica). In: Science. 296. Jahrgang, Nr. 5565, April 2002, S. 92–100, doi:10.1126/science.1068275, PMID 11935018, bibcode:2002Sci...296...92G (englisch).
  47. a b Tuskan GA, Difazio S, Jansson S, J. Bohlmann, I. Grigoriev, U. Hellsten, N. Putnam, S. Ralph, S. Rombauts: The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray). In: Science. 313. Jahrgang, Nr. 5793, September 2006, S. 1596–604, doi:10.1126/science.1128691, PMID 16973872, bibcode:2006Sci...313.1596T (englisch, unt.edu).
  48. a b Matsuzaki M, Misumi O, Shin-I T, Shinichiro Maruyama, Manabu Takahara, Shin-ya Miyagishima, Toshiyuki Mori, Keiji Nishida, Fumi Yagisawa: Genome sequence of the ultrasmall unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae 10D. In: Nature. 428. Jahrgang, Nr. 6983, April 2004, S. 653–7, doi:10.1038/nature02398, PMID 15071595, bibcode:2004Natur.428..653M (englisch).
  49. Derelle E, Ferraz C, Rombauts S, P Rouzé, AZ Worden, S Robbens, F Partensky, S Degroeve, S Echeynié: Genome analysis of the smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils many unique features. In: PNAS. 103. Jahrgang, Nr. 31, August 2006, S. 11647–52, doi:10.1073/pnas.0604795103, PMID 16868079, PMC 1544224 (freier Volltext), bibcode:2006PNAS..10311647D (englisch).
  50. Medizinexpert*innen bei DocCheck: Protist. Abgerufen am 18. November 2025.
  51. Experimentelle Taxonomie. Abgerufen am 18. November 2025.
  52. a b Douglas S, Zauner S, Fraunholz M, Margaret Beaton, Susanne Penny, Lang-Tuo Deng, Xiaonan Wu, Michael Reith, Thomas Cavalier-Smith: The highly reduced genome of an enslaved algal nucleus. In: Nature. 410. Jahrgang, Nr. 6832, April 2001, S. 1091–6, doi:10.1038/35074092, PMID 11323671, bibcode:2001Natur.410.1091D (englisch).
  53. a b Gardner MJ, Hall N, Fung E, Owen White, Matthew Berriman, Richard W. Hyman, Jane M. Carlton, Arnab Pain, Karen E. Nelson: Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum. In: Nature. 419. Jahrgang, Nr. 6906, Oktober 2002, S. 498–511, doi:10.1038/nature01097, PMID 12368864, PMC 3836256 (freier Volltext), bibcode:2002Natur.419..498G (englisch).
  54. a b Carlton JM, Angiuoli SV, Suh BB, Taco W. Kooij, Mihaela Pertea, Joana C. Silva, Maria D. Ermolaeva, Jonathan E. Allen, Jeremy D. Selengut: Genome sequence and comparative analysis of the model rodent malaria parasite Plasmodium yoelii yoelii. In: Nature. 419. Jahrgang, Nr. 6906, Oktober 2022, S. 512–9, doi:10.1038/nature01099, PMID 12368865, bibcode:2002Natur.419..512C (englisch).
  55. a b Xu P, Widmer G, Wang Y, Luiz S. Ozaki, Joao M. Alves, Myrna G. Serrano, Daniela Puiu, Patricio Manque, Donna Akiyoshi: The genome of Cryptosporidium hominis. In: Nature. 431. Jahrgang, Nr. 7012, Oktober 2004, S. 1107–12, doi:10.1038/nature02977, PMID 15510150, bibcode:2004Natur.431.1107X (englisch).
  56. a b Abrahamsen MS, Templeton TJ, Enomoto S, JE Abrahante, G Zhu, CA Lancto, M Deng, C Liu, G Widmer: Complete genome sequence of the apicomplexan, Cryptosporidium parvum. In: Science. 304. Jahrgang, Nr. 5669, April 2004, S. 441–5, doi:10.1126/science.1094786, PMID 15044751, bibcode:2004Sci...304..441A (englisch).
  57. a b Armbrust EV, Berges JA, Bowler C, BR Green, D Martinez, NH Putnam, S Zhou, AE Allen, KE Apt: The genome of the diatom Thalassiosira pseudonana: ecology, evolution, and metabolism. In: Science. 306. Jahrgang, Nr. 5693, Oktober 2004, S. 79–86, doi:10.1126/science.1101156, PMID 15459382, bibcode:2004Sci...306...79A (englisch).
  58. a b El-Sayed NM, Myler P, Bartholomeu DC, Nilsson D: The Genome Sequence of Trypanosoma cruzi, Etiologic Agent of Chagas Disease. In: Science. 309. Jahrgang, Nr. 5733, Juli 2005, S. 409–415, doi:10.1126/science.1112631, PMID 16020725 (englisch, gob.ar).
  59. a b Berriman M, Ghedin E, Hertz-Fowler CH, Blandin G: The genome of the African trypanosome Trypanosoma brucei. In: Science. 309. Jahrgang, Nr. 5733, Juli 2005, S. 416–422, doi:10.1126/science.1112642, PMID 16020726 (englisch).
  60. a b Ivens AC, Peacock CS, Worthey EA, Murphy L: The genome of the kinetoplastid parasite, Leishmania major. In: Science. 309. Jahrgang, Nr. 5733, Juli 2005, S. 436–442, doi:10.1126/science.1112680, PMID 16020728, PMC 1470643 (freier Volltext) – (englisch).